Alors pris en otage par les Genii menés par Kolya, les derniers atlantes présents dans la cité tentent de se défendre. Shepard tente tant bien que mal de se frayer un chemin parmi les patrouille tandis que Ford et Teyla arrivent en renfort, mais un ras de marré arrive sur la cité sans protection, et McKay affirme qu'elle détruira totalement la cité ...